启东市人杰地灵，基础教育全国闻名，在江苏省领先。启东市拥有国家级示范高中1所，江苏省重点学校8所，国家级重点职业中学1所。启东的普通高考成绩历年名列江苏省前茅，江苏省启东中学连续多年创造了1个班有20个左右的同学考取清华、北大的奇迹，在中学生国际奥林匹克学科竞赛中创造了“十三金二银”的佳绩，占江苏省的三分之二。

　　在2013美国首都华盛顿的中国研究中心发布的《中国260大最佳高中》中启东中学以满分100排名并列第一，同样获得满分的学校还有北京人大附中、湖北华中师大第一附中和北京四中。

　　截至2017年末，启东市拥有中小学及各类学校136所、各类学校在校学生87140人。2017年全年新增南通市数字化校园30所。全市教育现代化建设监测数据85.27分，比2016年提高5.48分。2017年高考文、理科均分分别超出省本科线39.05分和59.90分；普通类本一、本二上线率分别超出省平均19.7和33.4个百分点；对口单招本科上线率超省平均26.9个百分点，连续六年居南通市前三甲。19个省级课题、44个南通市级课题获准立项，数量和质量再创新高。